سپتوم واژینال عرضی یک ناهنجاری مادرزادی است که زمانی رخ می‌دهد که بخش‌های پایینی مجاری مولرین (Müllerian ducts) به طور کامل با سینوس ادراری-تناسلی (urogenital sinus) جوش نمی‌خورند، که منجر به باقی ماندن یک دیواره نازک یا ضخیم از بافت در واژن می‌شود. معمولاً یک دهانه کوچک در این بافت وجود دارد که اجازه می‌دهد مقداری از جریان قاعدگی عبور کند (انسداد جزئی)، اگرچه ممکن است انسداد به‌طور کامل نیز باشد. این ناهنجاری می‌تواند در هر سطحی از واژن، از نزدیکی دهانه تا نزدیکی دهانه رحم رخ دهد.

شیوع سپتوم واژینال عرضی در حدود 1:21,000 تا 1:70,000 نفر است. علت‌شناسی (اتیولوژی) آن ناشناخته است. اغلب این ناهنجاری‌ها در دوران نوجوانی و در رابطه با شروع یا انتظار شروع قاعدگی یا آغاز فعالیت جنسی مورد توجه قرار می‌گیرند.

بیماران ممکن است با شکایاتی از ناتوانی در استفاده از تامپون، ناتوانی در انجام رابطه جنسی نافذ، درد هنگام رابطه جنسی، خونریزی در حین یا پس از رابطه جنسی، درد لگنی دوره‌ای یا حاد، و قاعدگی غیرطبیعی یا عدم قاعدگی به پزشک مراجعه کنند.