خالکوبی تروماتیک زمانی رخ می‌دهد که اجسام خارجی به زور درون لایه درم (dermis) پوست نفوذ کرده و خالکوبی دائمی ایجاد می‌کنند. این ذرات ممکن است شامل ترقه، شن، فلز، شیشه، باروت، آسفالت، گرد و غبار، محصولات نفتی و گرافیت از جراحات ناشی از نوک مداد باشند. ساییدگی‌های تروماتیک (مانند آنچه پس از تصادف جاده‌ای رخ می‌دهد) بیش از انفجارها علت ایجاد خالکوبی تروماتیک هستند. حتی آسیب‌های جزئی، مانند نفوذ نوک مداد از طریق اپیدرم (epidermis)، نیز ممکن است مسئول باشند.

ذرات در زیر لایه‌های در حال بهبودی درم و اپیدرم به دام می‌افتند. در آسیب‌های ناشی از انفجار، ذرات ممکن است پشت زخم‌های ورودی فرو ریخته نیز گیر بیفتند. محل قرارگیری خالکوبی روی بدن بستگی به مکان وقوع تروما دارد. ضایعات از نظر اندازه و شکل به‌طور گسترده‌ای متفاوت هستند و معمولاً به رنگ‌های آبی، خاکستری یا سیاه دیده می‌شوند.